1938年甘肃省农业改进所设园艺组；1958年甘肃农业科学院成立园艺研究所，设置果树研究室；1978年10月成立果树研究所；2006年11月，果树研究所与兰州试验场整合，成立林果花卉研究所。目前全所职工51人，其中，研究员12人，副研究员16人；博士8人，硕士17人；入选甘肃省领军人才工程二层次4人，入选甘肃省省属科研院所学科带头人1人，享受国务院特殊特贴1人，全国五一劳动奖章获得者1人，博士生导师1人，硕士生导师5人。

一、方向任务

服务全省林果花卉产业发展，从事林果花卉种质资源收集、保存、评价与利用研究，新品种选育，栽培技术研究与集成创新，开展人才培养、技术示范、成果转化、科技服务与培训。

二、机构设置

科研机构：桃研究室、苹果研究室、梨研究室、葡萄研究室、特色林果研究室、花卉研究室、果树种苗扩繁与生产技术研究室、成果转化办公室。

管理机构：所办公室

三、科研条件

农业部西北地区果树科学观测实验站，甘肃省农业科学院高寒果树综合试验站，甘肃省农业科学院秦安试验站。在甘肃省林果主产区的静宁、秦安、清水、景泰、高台、永靖等建立苹果、桃、核桃、梨、葡萄、草莓试验示范基地26个。

甘肃省农业科学院果树生物技术与果树生理生态实验室，面积450m2，购置各类实验仪器90多台（套），设生理生化实验室、生态实验室、组织培养实验室、土壤实验室和分子实验室等5个专业实验室；有智能温室2栋、日光温室2栋，总面积1960 m2；办公室建筑面积1200m2。林果花卉种质资源保存圃及品种园300亩，保存资源1400多份。

四、科技成果

建所以来，共取得各类科研成果183项。获奖成果76项，其中获省部级奖38项、地（厅）级奖38项。自主选育审（认）定各类果树新品种31个，推广品种287个。近年来，自主培育的油桃新品种‘陇油桃1号’，普通桃新品种‘陇蜜9号’、‘陇蜜10号’、‘陇蜜12号’，核桃新品种‘陇薄香2号’，杏新品种‘陇杏2号’，苹果新品种‘金富’，梨新品种‘甘梨早6’、‘甘梨早8’、‘早玉’、‘甘梨3号’、葡萄新品种‘醉人香’、‘美红’等已开始在生产上大面积推广。